多层异构生物网络候选疾病基因识别

作者：丁苍峰; 王君; 张紫芸

来源：自动化学报, 2022, 1-15.

• 多层异构网络
• 生物网络
• 偏置随机游走
• 候选基因识别

现有大多数用于识别候选疾病基因的随机游走方法通常优先访问高度连接的基因,而可能与已知疾病有关的不知名或连接性差的基因易被忽略或难以识别.此外,这些方法仅访问单个基因网络或各种基因数据的聚合网络,导致偏差和不完整性.因此,设计一种能控制随机游走运动方向和整合多种数据源的候选疾病基因识别方法将是一个迫切需要解决的问题.为此,本文首先构建多层网络和多层异构基因网络.然后,提出了一种游走于多层和多层异构网络的拓扑偏置随机游走（Biased random walk with restart, BRWR）算法来识别疾病基因.实验结果表明,游走于不同类型网络上的识别候选疾病基因的BRWR算法优于现有的算法.最后,应用于多层异构网络上的BRWR算法能预测未诊断的新生儿类早衰综合征中涉及的疾病基因.

• 单位
  延安大学