高通量测序同时检测样本中RNA病毒与DNA病毒混合感染

作者：于诗筠; 崔鹤馨; 文会淇; 喻鑫婷; 吕金晖; 张雅倩; 张湘莉兰; 崔玉军; 米志强^*; 黄海龙^*

来源：中国兽医学报, 2022, 42(04): 675-679.

DOI：10.16303/j.cnki.1005-4545.2022.04.10

• RNA建库
• 高通量测序
• DNA病毒
• RNA病毒
• 猫传染性腹膜炎病毒(FIPV)
• 猫星状病毒(FeAstV)
• 犬细小病毒(CPV)

传统病原学检测方法对于兽医临床感染病原的鉴定具有一定的局限性，尽管高通量测序技术极大地提高了未知病原感染的检测水平，但是对于无DNA复制周期的RNA病毒的捕获，仍存在一定难度。基于此，本研究利用RNA建库技术对1例猫传染性腹膜炎的腹水与血清样本进行了高通量测序，并对所得数据进行分析以判断感染病原，结果提示病猫腹水样本中携带猫传染性腹膜炎病毒(FIPV)、猫星状病毒(FeAstV)与犬细小病毒(CPV),血清样本中携带猫传染性腹膜炎病毒(FIPV),其中，FIPV与FeAstV为正链RNA病毒，CPV为单链DNA病毒。总之，本研究不仅证实基于RNA建库的高通量测序技术能够同时检测到DNA与RNA病毒混合感染，而且能够为动物未知病原感染的检测提供新思路与参考。

• 单位
  吉林农业大学; 病原微生物生物安全国家重点实验室; 长春市农业科学院