结核病患者中靶向调控维生素D受体的microRNA的初步筛选

作者：肖敏; 杨松; 陈杨; 李同心; 杨仕明^*; 林辉^*

来源：中华肺部疾病杂志(电子版), 2020, 13(06): 731-736.

• 肺结核病
• microRNA
• 维生素D
• 高通量测序
• 生物信息学

目的筛选与结核病相关,且靶向调控维生素D受体(vitamin D receptor,VDR)的microRNA(miRNA),为深入研究维生素D(vitamin D,Vit D)辅助抗结核病机制及其临床应用提供一定的参考依据。方法选择5例明确诊断肺结核病患者和5例非结核病的志愿者作为研究组和对照组。分别收集临床基线资料以及采集两组外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)作为临床样本,提取总RNA后,采用高通量测序技术(high-throughput sequencing),检测两组间的miRNA差异表达情况。结果 5例肺结核病患者和5例非结核病志愿者临床基线资料经统计学分析得出两组间23项指标的同质性和异质性,其中性别、年龄、吸烟饮酒习惯等两组间无统计学差异;体重指数(BMI)、总胆固醇(TC)、血红蛋白(Hb)白蛋白(ALB)、球蛋白(GLB)及总蛋白(TP)研究组低于对照组,有统计学差异(P<0.05)。高通量测序从研究组和对照组5对样本中共筛选出1 560条miRNAs,得到miRNA在两组中差异表达谱。分层聚类和火山图进一步综合分析发现研究组中最有差异的23条miRNAs(P<0.05),其中15条miRNAs在研究组中表达下(∣LOG2FC∣>1),8条miRNAs表达上调(FC>1)。综合高通量测序结果和生物信息学预测,从差异表达谱中筛选出2条有统计学意义且靶向VDR的miRNAs:hsa-miR-326(P<0.05、FC=1.37)、hsa-miR-654-5p(P<0.05、∣LOG2FC∣=1.06)。结论通过临床样本高通量测序分析及生物信息学预测,发现了结核病中的既差异表达又靶向VDR的两条miRNAs,这两条miRNAs可能是肺结核病潜在的诊断标志及新的治疗靶点,为结核病的防治提供了新的策略和方向。

• 单位
  重庆市公共卫生医疗救治中心