科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
目的 通过生物信息学方法研究细胞周期素依赖性激酶1(Cyclin-dependent kinase 1,CDK1)在肝癌(Hepatocellular carcinoma, HCC)组织中的表达差异，探索其在肝癌预后和免疫细胞浸润间的作用。方法 从GEO数据库下载肝癌数据集，使用R软件分析差异基因，并取交集基因；通过GO和KEGG分析富集通路；使用STRING和cytoscape构建差异基因互作网络，结果可视化获取核心基因CDK1;UALCAN和GEPIA数据库分析肝癌中CDK1的表达水平，及其与临床特征的关系；HPA数据库分析CDK1蛋白在肝癌组织和正常组织的表达差异；通过Kaplan-Meier Plotter分析CDK1表达水平与HCC预后的关系；TIMER数据库分析CDK1与HCC肿瘤免疫细胞浸润、免疫细胞表面标记物的相关性。结果 3个肝癌数据集筛选出共有的347个差异基因；KEGG通路显示差异基因主要参与细胞周期通路；与正常组织相比，CDK1基因在HCC组织中表达水平升高；CDK1高表达与肿瘤分期、年龄均有相关性；生存分析结果表明CDK1基因高表达患者生存时间明显低于低表达患者。CDK1基因与HCC中多种免疫细胞浸润水平及其表面标记物显著相关。结论 CDK1基因在HCC中表达上调，高表达的CDK1肝癌患者预后不良，并且影响HCC免疫浸润水平。CDK1基因可能为HCC新的免疫治疗靶点。
-
单位山西医科大学汾阳学院
