黑条小车蝗线粒体基因组特征及其系统发育分析

作者：兰世强; 马钰洁; 蒲雪; 季荣; 袁亮

来源：基因组学与应用生物学, 2023, 42(08): 832-844.

DOI：10.13417/j.gab.042.000832

• 黑条小车蝗
• 线粒体基因组
• 小车蝗属
• 系统发育分析

为解析黑条小车蝗（Oedaleus decorus decorus）线粒体基因组特征及其在小车蝗属的系统发育地位，本研究利用长距离PCR技术和引物步移法测序对黑条小车蝗线粒体全基因组进行扩增和组装。结果表明，黑条小车蝗线粒体基因为典型双链环状DNA，全长15 914 bp,A+T含量为75.07%，包含13个蛋白编码基因、22个t RNA编码基因、2个rRNA编码基因和1个位于小核糖体RNA(small rRNA, srRNA)和tRNAIle之间的非编码控制区（D-loop区）。黑条小车蝗线粒体基因组中编码基因的数量及位置排序与小车蝗属其他近源种一致。黑条小车蝗线粒体13个蛋白编码基因的起始密码子均为ATN模式，除ND5使用不完整的T为终止密码子外，其他基因均使用完整的TAA作为终止密码子。22个tRNA编码基因中，21个能形成三叶草结构，只有tRNASer缺少DHU环。预测大核糖体RNA(large rRNA, lrRNA)二级结构共有6个结构域（结构域Ⅲ缺失）和47个茎环结构，预测srRNA二级结构包含3个结构域和31个茎环结构。基因间隔序列共计16处94 bp，间隔序列1～21 bp不等。基因重叠区共计11处47 bp，重叠序列1～8 bp不等。在D-loop区检测出4组重复序列，序列范围在27～155 bp。系统发育分析表明，在小车蝗属中，黑条小车蝗与亚洲小车蝗亲缘关系较近，二者聚为姊妹群，然后与隆叉小车蝗聚为一个支系，黄胫小车蝗与红胫小车蝗聚为姊妹群，形成另一个支系，这两个支系再聚为姊妹群。本研究支持亚洲小车蝗为黑条小车蝗亚种。

• 单位
  新疆师范大学; 生命科学学院