高通量测序技术在甲基丙二酸血症基因诊断中的应用及其局限性

作者：苏利沙; 胡爽; 孔祥东^*

来源：中华医学遗传学杂志, 2021, 38(08): 740-744.

• 甲基丙二酸血症
• 高通量测序
• MMACHC基因

目的对31个甲基丙二酸血症家系进行相关致病基因检测, 以明确基因诊断并为家系产前诊断提供依据。方法针对2017年1月到2019年6月到郑州大学第一附属医院门诊进行咨询的31个甲基丙二酸血症家系, 采用高通量测序技术对先证者进行基因变异检测, 对致病/疑似致病基因变异进行Sanger测序验证并对先证者父母进行Sanger测序以追踪变异的来源, 对只检测到MMACHC基因杂合变异的先证者用实时荧光定量PCR对MMACHC基因外显子缺失/重复进行检测。针对检测到致病/疑似致病变异的25个家系, 对其中8名孕妇进行产前诊断。结果 25个家系检测到致病/疑似致病基因变异(检出率80.65%), 3个家系检测到MMACHC基因存在外显子杂合缺失合并杂合变异(检出率9.67%), 总检出率90.32%, 其中18个家系为MMACHC基因变异(3个家系存在外显子杂合缺失, 共12种基因变异, 其中1个新变异), 7个家系为MUT基因复合杂合变异(共11种基因变异, 2个新变异), 1个家系为HCFC1 c.3356C>T(p.Thr1119Ile)半合子变异所致甲基丙二酸尿症伴同型半胱氨酸尿症Cb1X型, 1个家系为PCCB基因复合杂合变异所致丙酸血症, 1个家系为SUCLG1基因纯合变异所致线粒体DNA缺失综合征9型。产前诊断结果提示4名胎儿未检测到MMA相关基因致病变异, 1例胎儿为MUT基因杂合变异携带者, 3例胎儿为MACHC基因复合杂合变异患儿。结论高通量测序技术可以高效、准确筛选出甲基丙二酸血症及其他代谢病相关致病基因变异, 但存在不能检测出致病基因外显子拷贝数异常的局限, 其联合实时荧光定量PCR对致病基因外显子拷贝数进行检测能够提高MMA基因变异检出率, 明确基因诊断并为相关家系的产前诊断提供指导。

• 单位
  郑州大学第一附属医院