16S rDNA测序探讨藏族和汉族肠易激综合征患者肠道菌群的差异

作者：宦徽; 涂庆丽; 魏清; 李骥; 陈茉; 万慧敏; 许立^*

来源：中国临床研究, 2020, 33(12): 1601-1606.

DOI：10.13429/j.cnki.cjcr.2020.12.001

• 肠易激综合征
• 肠道菌群
• 藏族
• 汉族
• 16S核糖体脱氧核糖核酸
• 高通量测序

目的通过16S核糖体脱氧核糖核酸(16S rDNA)测序方法分析藏、汉族肠易激综合征(IBS)患者的肠道菌群差异。方法选取2018年4月至2019年1月确诊的藏族(25例)和汉族(20例)IBS患者作为研究对象,采用Illumima Miseq对两组粪便进行16S rDNA测序,并对测序结果进行生物信息学分析。结果 Simpson指数显示,藏族IBS患者肠道菌群的物种多样性显著低于汉族IBS患者(P=0.030 6)。物种差异分析显示,藏族IBS组中拟杆菌门(Bacteroidetes)和普雷沃菌9属(Prevotella9)丰度以及肠道菌群定植抗力拟杆菌门/厚壁菌门(B/F)值都显著高于汉族IBS组(P=0.016 99,0.000 934 1和0.006 644),而拟杆菌属(Bacteroides)、布劳特菌属(Blautia)和霍氏真杆菌属(Eubacterium-hallii)丰度则显著低于汉族IBS组(P=0.040 91、0.000 108 1和0.036 49)。基于未观测状态重建的群落系统发育研究(PICRUSt)功能预测分析显示,藏族IBS组的蛋白质同源群簇(COG)功能分类和京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能预测与汉族IBS组之间基本无差异。结论与汉族比较,藏族IBS患者肠道菌群失调情况较轻,肠道菌群定植抗力增强,致病菌减少,有益菌增加,该结论可为藏族IBS患者的个性化治疗方案提供依据。

• 单位
  西藏自治区人民政府驻成都办事处医院