新型冠状病毒进化与变异

作者：莘召; 苟秋凤; 焦秋霞; 潘渠^*

来源：生命的化学, 2021, 41(02): 215-222.

DOI：10.13488/j.smhx.20200608

• 新型冠状病毒
• 刺突蛋白基因
• 系统进化
• 突变

本文分析了新型冠状病毒(SARS-CoV-2,新冠病毒)的进化来源及刺突蛋白(spike protein, S)基因的突变情况。从GenBank数据库中下载相关病毒全基因组序列及S基因序列,运用DNAMAN 9.0、MEGAX等生物信息学软件,进行多序列比对,构建系统进化树,并统计S基因位点突变情况。分析结果提示,新冠病毒不可能来源于已知的6种人冠状病毒,相较于穿山甲,新冠病毒来源于蝙蝠的可能性更大。S基因的突变率应该和新冠病毒的流行时间及感染人数密切相关。未来,类似于SARS、MERS和新冠病毒这样由动物传播至人的冠状病毒可能还会出现,其流行趋势将取决于其致病性和变异性。

• 单位
  成都医学院