盆底器官脱垂疾病mRNA和lncRNA差异表达谱的综合分析

作者:张志磊; 赵冰*; 刘灵; 王君敏; 李林玉; 梁肖; 王莹莹; 王肖帆; 乔艳华
来源:郑州大学学报(医学版), 2020, 55(02): 236-242.
DOI:10.13705/j.issn.1671-6825.2019.10.047

摘要

目的:探讨盆腔器官脱垂(POP)发生发展的分子机制。方法:取6例POP和6例良性子宫病变患者子宫主韧带标本,进行病理组织形态学分析;同时提取RNA进行转录组高通量基因测序,通过Gene Ontology(GO)和KEGG数据库对差异表达的mRNA和lncRNA进行功能和通路的富集分析,进一步构建蛋白互作网络(PPI)和mRNA-lncRNA共表达网络找出核心差异基因。应用qRT-PCR和Western blot进行验证。结果:POP组患者主韧带组织中的纤维细弱多断裂,且走向紊乱。筛选出差异表达的mRNA 794个、lncRNA 1 106个。GO分析主要富集于核小体组装、物质代谢过程及对刺激的反应等,KEGG途径主要富集于Wnt/β-Catenin信号通路、细胞周期和组蛋白调控通路等。PPI网络中IL-6是连接度最广的核心基因,与其共表达的lnc-ZNF727-12∶2明显下调。qRT-PCR和Western blot验证结果与测序结果相符。结论:POP是一个多基因参与的疾病,IL-6和lnc-ZNF727-12∶2可能参与了POP的发生发展。