利用Illumina高通量测序技术筛选低温降解玉米秸秆真菌

作者：徐丽萍; 姜喆; 葛英亮^*; 王鑫; 倪燕

来源：食品工业科技, 2020, 41(20): 99-103.

DOI：10.13386/j.issn1002-0306.2020.20.016

• 高通量测序
• 真菌菌群
• 筛选
• 降解
• 鉴定

玉米秸秆及根际土壤中纤维素降解菌资源丰富,本研究旨在分析其真菌群落结构及低温纤维素降解真菌的筛选。采集玉米秸秆及根际土壤,利用高通量测序方法对其中的真菌群落结构进行生物信息学分析,以羧甲基纤维素钠为唯一碳源,筛选低温纤维素降解真菌并通过ITS测序进行菌种鉴定。结果表明,对玉米秸秆及秸秆根部土壤测序共获得20715913 bp,共拼接成82250个基因片段,平均长度为249.29 bp,其中共发现5个真菌门,确定共有的优势菌属为Guehomyce;通过在15℃低温筛选、比较0、5、10、15℃低温下经刚果红染色产生的透明圈与菌落直径的比值得到3株产酶能力较强的纤维素降解真菌,分别为FB1、FB7、FB8。结合液态发酵测定其降解率分别是27.66%、21.53%、23.01%,最终确定菌株FB1分泌纤维素酶效果最好、降解效果最佳,经鉴定后确认为假枝孢菌(Cladosporium pseudocladosporioides)。

• 单位
  东北农业大学; 海南热带海洋学院; 哈尔滨商业大学