基于外显子组测序的Axenfeld-Rieger综合征致病突变筛查

作者：王琦; 刘鑫娜; 邵正波; 原慧萍^*

来源：中华实验眼科杂志, 2022, 40(10): 929-934.

DOI：10.3760/cma.j.cn115989-20200802-00555

• Axenfeld-Rieger综合征
• 家系
• 基因检测
• 全外显子组测序
• PITX2基因
• 移码突变

目的对Axenfeld-Rieger综合征(ARS)一家系进行临床检查和基因检测, 寻找致病突变。方法采用家系调查研究方法, 纳入2018年于哈尔滨医科大学附属第二医院就诊的中国汉族ARS一家系, 该家系3代共15人, 其中患者3例。详细记录家族史, 进行眼科及全身一般检查。采集受检者外周静脉血2～5 ml并提取淋巴细胞基因组DNA和RNA。对先证者DNA进行外显子测序, 利用人群数据库及生物信息学分析筛选可疑突变, Sanger测序和实时荧光定量PCR进行验证, 对可疑突变进行保守性和有害性预测, 参照美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)遗传变异分类标准与指南对候选罕见变异进行致病性评估。结果 3例患者均存在ARS典型的眼部、牙齿和肚脐发育异常, 且均携带PITX2基因c.525delC(p.Asp175Glufs*)杂合突变, 家系中其他人员无相应临床表型且未检测到该变异位点, 符合家系共分离。3例患者PITX2 mRNA相对表达量为0.672±0.063, 明显低于健康对照的1.015±0.179, 差异有统计学意义(t=8.847, P<0.001)。dbSNP、1000G、gnomeAD、ExAC、Korea1K、EVS数据库中均未收录该变异, MutationTaster评为有害, 受影响的氨基酸序列在9种动物中保守存在。ACMG遗传变异分类标准和指南评价该变异位点为致病变异。结论 PITX2基因c.525delC(p.Asp175Glufs*)变异为该家系患者的致病变异, 首次在中国ARS家系中报道。

• 单位
  哈尔滨医科大学; 哈尔滨医科大学附属第二医院