花椰菜苗期黑腐病抗、感品种转录组差异表达分析

作者：姚玉荣; 霍建飞; 郝永娟; 贲海燕; 王万立

来源：山东农业科学, 2020, 52(07): 1-6.

DOI：10.14083/j.issn.1001-4942.2020.07.001

• 花椰菜
• 黑腐病
• 转录组
• 差异表达基因

为研究花椰菜抗黑腐病的分子机制,本试验利用Illumina测序平台的RNA-Seq技术对花椰菜黑腐病感病品种Y1-2和抗病品种EC-247接种黑腐病菌5 d后的样本进行高通量转录组分析,采用RSEM软件计算基因表达量,并在此基础上筛选两组样本间的差异表达基因。结果显示,抗、感品种间差异表达基因共3 195个,其中上调表达基因1 424个,下调表达基因1 771个。通过GO和KEGG进行基因功能显著性富集分析发现,差异表达基因主要富集于苯丙烷类代谢、次级代谢产物合成、逆境响应、MAPK信号通路等途径。本研究结果可为解析花椰菜与黑腐病互作机制、挖掘黑腐病抗病基因提供参考。

• 单位
  植物保护研究所