柯萨奇病毒B组3型上海分离株的基因特征分析

作者：李云逸; 杨玉颖; 崔心怡; 费洁; 仲文江; 李淑佩; 周艳秋^*; 陈敏^*

来源：微生物与感染, 2023, 18(02): 91-96.

• 柯萨奇病毒B组3型
• 环境污水监测
• 基因特征

为探讨上海市不同来源的柯萨奇病毒B组3型(coxsackievirus B3,CVB3)菌株的循环动态变化及基因特征，本研究对分离自上海市环境污水、健康儿童和急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis, AFP)病例中的CVB3菌株进行VP1区基因序列测定，并对照全球CVB3代表株进行序列相似性分析和系统发生学分析。结果显示，1989—2021年上海市不同来源的CVB3分离株共有120株，属于D、E基因亚型。上海CVB3分离株的核苷酸和氨基酸相似性差异较大，分别为78.7%～100%和93.3%～100.0%。2016年首次从上海环境污水中分离到E基因亚型CVB3,2021年再次分离到该基因亚型。2021年上海环境污水中的E基因亚型CVB3分离株与2020年的广东手足口病(hand, foot, and mouth disease, HFMD)病例CVB3分离株VP1区的核苷酸相似性较高，但上海暂未有该基因亚型感染病例报道。因此，仍须长期对环境污水和不同肠道病毒感染病例进行监测，以提高肠道病毒监测的敏感性，为肠道病毒相关疾病的诊疗提供数据支撑。

• 单位
  上海市疾病预防控制中心