葡萄糖激酶基因6个标签单核苷酸多态性位点与2型糖尿病的相关性研究

作者：张秀明; 孙各琴; 李晶晶; 韩慧; 陈琼

来源：中华检验医学杂志, 2015, 38(12): 827-832.

DOI：10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2015.12.009

• 糖尿病, 2型
• 葡糖激酶
• 多态性, 单核苷酸

目的探讨葡萄糖激酶(glucokinase, GCK)基因6个标签单核苷酸多态性(tag single–nucleotide polymorphisms, tagSNPs)位点rs2971672、rs12702070、rs2268569、rs2268573、rs2300587、rs1476891与2型糖尿病(type 2 diabetes, T2D)的关系。方法病例对照研究。选取2013年8月至2014年12月在中山大学附属中山医院住院的中国南方汉族T2D患者499例(T2D组), 同时选择在该院康体保健中心体检的汉族健康人499名作为对照组, 对GCK基因的6个tagSNPs位点采用改良多重高温连接酶检测反应技术(improved multiple ligase detection reaction, iMLDR)进行基因分型, 应用Hardy–Weinberg平衡规律检测样本代表性, 采用χ2检验、logistic回归分析比较T2D组和对照组基因型和等位基因频率的差异, 并在加性、显性和隐性3种遗传模型下对各SNP位点进行相关性分析。应用Haploview软件构建GCK基因6个tagSNPs位点的单体型, 分析是否存在连锁不平衡(linkage disequilibrium, LD)及不同的GCK单体型与T2D易感性的关系。结果 rs2268573、rs2300587、rs2268569、rs1476891的基因型(χ2值分别为3.361、2.076、0.582、0.918, P均>0.05)和等位基因频率(χ2值分别为0.222、1.980、0.590、0.851, P均>0.05)在T2D组和对照组之间差异均无统计学意义。rs2971672和rs12702070的基因型(χ2值分别为6.896、7.990, P均<0.01)和等位基因分布(χ2值分别为4.708、5.979, P<0.05、P<0.01)在D2M组和对照组之间差异有统计学意义。在显性遗传模式下(rs2971672:OR=1.74, 95%CI=1.17～2.57, P<0.01;rs12702070:OR=1.54, 95%CI=1.17～2.04, P<0.01)以及在加性遗传模式下(rs2971672:OR=1.51, 95%CI=1.06～2.14, P<0.05;rs12702070:OR=1.26, 95%CI=1.04～1.52, P<0.05)2个SNP位点的基因型分布在D2M组和对照组之间差异有统计学意义。GCK基因6个位点中的5个位点有两个LD域, rs2971672和rs2300587共存在TC、TA、CA三种主要单体型, 单体型TA和CA均降低个体患T2D的风险, OR值分别为0.81(95%CI: 0.66～1.00, P<0.05)和0.78(95%CI: 0.62～0.98, P<0.05)。rs2268569、rs12702070和rs1476891共存在TAG、TGG、TAT、CGG四种主要单体型, 均与个体患T2D的风险无相关性(χ2=2.718, P>0.05)。结论在汉族人群中, GCK基因区域的rs2971672和rs12702070位点与糖尿病遗传易感性密切相关, 而rs2268573、rs2300587、rs2268569、rs1476891位点与糖尿病遗传易感性无明确相关性。rs2971672和rs2300587LD域单体型TA和CA均降低个体患T2D的风险;rs2268569、rs12702070、rs1476891 LD域四种主要单体型均与个体患T2D的风险无相关性。(中华检验医学杂志, 2015, 38:827–832)

• 单位
  中山市人民医院