DNA甲基化位点对肺腺癌预后的作用研究

作者：刘颖; 方子晗; 张雅琴; 王可^*

来源：广州医药, 2022, 53(03): 112-117.

DOI：10.3969/j.issn.1000-8535.2022.03.026

• 肺腺癌
• TCGA数据库
• DNA甲基化
• 预后

目的 使用TCGA数据库，探索DNA甲基化位点对肺腺癌的预后影响。方法 使用TCGA数据库，获取肺腺癌病人癌和癌旁组织甲基化表达数据、基因表达数据及临床数据；将人群分为探索组和验证组，使用LASSO在探索人群中筛选对肺腺癌预后有影响的甲基化位点；受试者工作特征曲线用于评估甲基化位点预测效果，并进一步在验证人群中验证。结果 在TCGA数据库中筛选出158个癌和癌旁组织差异表达且与所在基因mRNA表达显著相关的甲基化位点，经LASSO回归分析，cg19378330与肺腺癌预后相关。甲基化位点水平高于中位数的患者，归入高风险组，甲基化位点水平低于中位数的为低风险组。结果发现与低风险组相比，高风险组的死亡风险比低风险组增加了38%(OR=1.38,95%CI=1.16～2.69)。在探索阶段人群中其曲线下面积为0.80(95%CI=0.73～0.88),灵敏度为86.2%。验证人群中也表现出类似结果。结论 甲基化位点cg19378330与肺腺癌具有较显著的关联性，且可以对肺腺癌的风险进行有效的预测。

• 单位
  襄阳市中心医院; 基础医学院; 广州市第一人民医院; 湖北文理学院