中华蜜蜂幼虫肠道响应球囊菌胁迫的可变剪切基因分析

作者：郭睿; 李龙; 熊翠玲; 郑燕珍; 付中民; 王海朋; 赵红霞; 陈大福^*

来源：四川大学学报(自然科学版), 2018, 55(06): 1313-1318.

• 中华蜜蜂
• 幼虫肠道
• 球囊菌
• 胁迫
• 可变剪切

基于前期已获得的中华蜜蜂(简称中蜂)幼虫肠道转录组数据,利用TopHat2软件在正常(AcCK)及球囊菌胁迫的中蜂幼虫肠道样品(AcT1、AcT2、AcT3)中共鉴定出发生于9124个基因的57327个可变剪切事件,其中以基因间(17.68%)、可变3′端剪切(15.32%)、外显子跨越(14.12%)和可变5′端剪切(12.81%)类型为主.Venn分析结果显示4个肠道样品的共有可变剪切基因数为8111个,特有可变剪切基因数分别为272、189和385个.GO分类结果显示共有可变剪切基因涉及47个条目,AcT1、AcT2、AcT3的特有可变剪切基因分别富集于24、20和34个条目.KEGG代谢通路富集分析结果显示,共有可变剪切基因富集在327个代谢通路,基因富集数最多的是RNA转运、内质网蛋白加工及核糖体;AcT1、AcT2、AcT3的特有可变剪切基因分别富集在22、46和83个代谢通路.结果揭示了可变剪切基因在宿主的胁迫响应过程中的重要作用.

• 单位
  福建农林大学; 广东省生物资源应用研究所