大葱AfCER1基因的克隆及表达分析

作者：奥娜; 赵泓; 裴雁曦; 王永勤

来源：山西农业科学, 2016, 44(05): 569-582.

• 大葱
• 蜡质
• Af CER1
• 基因克隆
• 表达分析

基于大葱RNA-seq转录组数据库中蜡质相关基因Af CER1的序列设计引物,利用RT-PCR(Reverse transcription-polymerase chain reaction)和RACE(Rapid amplification of c DNA ends)技术获得Af CER1(Allium fistulisum CER1)的全长c DNA序列,并通过生物信息学手段分析基因的序列;利用RT-PCR和Real-time PCR分析Af CER1基因在大葱野生型和突变型植株中的空间表达模式。结果表明,Af CER1基因全长为2 144 bp,包含一个1 857 bp完整的开放阅读框(ORF),编码618个氨基酸。蛋白序列比对分析表明,Af CER1与其他物种的CER1具有相似的结构域:脂肪酸羟化酶结构域和WAX2-C结构域。由RT-PCR的结果可知,Af CER1基因在大葱的根、叶鞘、叶片等部位均有表达,且在野生型和突变型植株中的表达量有差异。Real-time PCR分析表明,在大葱的根和叶鞘及刚见光的叶片中,Af CER1在突变型植株中的表达量相对野生型少;而在见光较多的叶片部位,Af CER1在突变型植株中的表达量却比野生型多。研究可为大葱蜡质合成的分子机制提供理论基础。

• 单位
  北京市农林科学院蔬菜研究中心; 农业部; 山西大学; 生命科学学院