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摘要
目的探究AJUBA基因对于雌激素受体阳性乳腺癌细胞T47D基因表达的影响。方法构建AJUBA稳定过表达的T47D细胞系。载体对照组和实验组分别提取RNA进行转录组测序技术(RNA-seq)测序,将所得序列映射到人类基因组并进行转录组重建,样本标准化后寻找实验组和对照组之间的差异基因,利用生物信息学方法进一步对所得的差异基因进行基因本体论(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集性分析,同时挑选部分基因用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-q PCR)进行基因表达验证。结果实验组与对照组细胞相比共找到568个差异基因,其中上调基因239个,下调基因329个。GO分析中,注释到分子功能、生物学过程和细胞组成的上调差异基因分别有3、23、8个;下调差异基因分别有21、35、9个。KEGG分析中上调基因显著富集通路有2个,下调基因显著富集通路有4个。结论 AJUBA过表达可以影响T47D细胞的一系列生物学过程相关的多条信号通路,可能在乳腺癌发生、发展中起重要作用。
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