校院两级管理是民办高校体制优化和改革的重要方面,有助于突破民办高校发展瓶颈,提升民办高校教育和办学的活力。民办高校管理存在职能部门认识有偏差、校院两级责权划分模糊、监督管理机制不够完善、校内学院划分不合理和管理水平较低等问题。应统一校院两级管理理念,明确校院权责,完善管理监督机制,切实提高民办高校管理水平。