水牛CART基因的克隆测序及蛋白质结构与功能预测

作者：于农淇; 鄢胜飞; 覃广胜; 尚江华; 郑海英; 杨春艳^*

来源：畜牧与兽医, 2020, 52(02): 1-6.

• CART
• 水牛
• 蛋白质功能预测

为探讨水牛可卡因-苯丙胺调节转录肽(cocaine-and amphetamine-regulated transcript, CART)基因功能,以水牛卵巢组织RNA转录的cDNA为模板,参考GenBank预测的水牛CART基因组序列设计引物,采用PCR和在线生信分析软件对CART基因进行克隆和蛋白质结构预测分析。结果显示:水牛CART基因CDS区全序列长为351 bp,编码116个氨基酸;对所得核酸序列和蛋白质结构分析预测显示,水牛CART基因与美洲野牛、野牦牛、普通牛、羊、双峰驼、单峰驼、野猪、马、非洲野驴、人类及猕猴相似程度分别为100%、98%、100%、98%、91%、91%、78%、85%、85%、81%、90%;Mega分析显示在多胃反刍动物间有较高同源性;蛋白质结构预测显示,CART蛋白含有N端信号肽,是分泌蛋白,功能与神经、辅酶和离子结合相关。

• 单位
  中国农业科学院广西水牛研究所; 广西壮族自治区水牛研究所