北京地区诺如病毒分子生物学特点初步研究

作者:高志勇; 严寒秋; 罗明; 刘桂荣; 刘园; 吴晓娜; 贾蕾; 王全意; 黄芳; 吴疆; 庄辉
来源:中华流行病学杂志, 2007, 28(07): 671-675.

摘要

目的了解北京地区诺如病毒的分子生物学特点。方法收集北京市2007年1-3月非细菌性胃肠炎暴发和散发病例,采集患者粪便标本,使用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)对粪便标本进行诺如病毒RNA检测,对RT-PCR阳性标本的PCR产物进行克隆测序。结果检测38例粪便标本,共有27例阳性。随机选择其中4例PCR产物进行克隆测序,获得4株诺如病毒序列进行比对分析,结果显示,该4株病毒序列与诺如病毒GⅡ/4型参考株同源性最高,其中与荷兰和日本提交的诺如病毒GⅡ/4型变异株最为接近,同源性分别为97.8%~98.5%和95.2%~95.9%。系统发生树分析表明,该4株诺如病毒与荷兰、日本流行的GⅡ/4型变异株处于同一分支上。结论北京地区存在诺如病毒GⅡ/4型变异株流行,其与2006年荷兰和日本的诺如病毒流行株属同一类GⅡ/4型变异株。