甜玉米籽粒体积和粒重的全基因组关联分析

作者：肖颖妮; 李高科; 李坤; 于永涛; 李光玉; 李武; 高颖珊; 胡建广

来源：中国农业大学学报, 2022, 27(07): 12-25.

DOI：10.11841/j.issn.1007-4333.2022.07.02

• 甜玉米
• 籽粒体积
• 粒重
• 全基因组关联分析

为挖掘控制甜玉米籽粒体积和粒重的相关基因，2017—2019年，以209份甜玉米自交系构成的关联群体为材料，测定干籽粒的体积和粒重，结合全基因组重测序（De novo sequencing）获得的980万个单核苷酸多态性（Single-nucleotide polymorphism,SNP）标记，采用GLM模型进行全基因组关联分析。结果表明，甜玉米籽粒体积变异范围为0.06～0.15mL，变异倍数为2.5倍，单粒重变异范围为0.08～0.17g，变异倍数为2.1倍，均符合正态分布。共检测到15个SNP位点与籽粒体积或粒重显著关联，分别解释籽粒体积55.7%和粒重52.1%的表型变异，其中4个位点和普通玉米报道的QTL重叠，其余11个是新鉴定的位点，通过基因注释发现大部分候选基因为转录因子等调控基因。此外，首次检测到Br2（矮化基因2）与籽粒体积、粒重两性状均显著关联，并且籽粒体积和粒重均随着该基因表达量的升高而增加。

• 单位
  广东省农业科学院作物研究所