新型冠状病毒2019-nCoV与动物冠状病毒进化关系分析

作者：王楷宬; 庄青叶; 李阳; 姜利建; 张富友; 姜楠; 刘华雷^*

来源：中国动物检疫, 2020, 37(03): 3-12.

DOI：10.3969/j.issn.1005-944X.2020.03.002

• 新型冠状病毒
• 动物冠状病毒
• 遗传进化

新型冠状病毒(2019-nCoV)感染肺炎疫情自2019年12月在湖北省武汉市发生以来,已在我国和世界多个国家传播,引发全球关注。为阐明2019-nCoV与已知动物冠状病毒的关系,从冠状病毒的宿主分布、遗传进化分析、宿主受体分析等角度,对2019-nCoV的可能来源进行了综合分析。结果显示:2019-nCoV与从云南省中菊头蝠中检测到的冠状病毒分离株RaTG13基因组同源性最高,为96.2%,两者遗传进化关系也较为接近;从我国广东省和广西壮族自治区查获的走私穿山甲中检测到的冠状病毒则与2019-nCoV遗传关系相对稍远,与2019-nCoV基因组同源性分别为90.4%和85.5%;2019-nCoV与已知家畜、家禽,以及犬猫等宠物中检测到的冠状病毒基因组同源性≤54.2%,遗传进化关系较远。结合监测结果,基本排除2019-nCoV来源于已知家畜、家禽以及犬猫等宠物冠状病毒的可能性。

• 单位
  中国动物卫生与流行病学中心