苦荞漆酶基因的克隆与生物信息学分析

作者：杨晓琳; 段迎; 蔡苏云; 贺润丽^*; 尹桂芳; 王艳青; 卢文洁; 孙道旺; 王莉花^*

来源：作物杂志, 2022, (03): 73-79.

DOI：10.16035/j.issn.1001-7283.2022.03.010

• 苦荞
• 漆酶
• 基因克隆
• 生物信息学
• 表达分析

利用RT-PCR技术从苦荞中克隆出2条漆酶（laccase）基因，运用生物信息学技术对2个基因序列进行分析，预测结构域、二级和三级蛋白结构，进行蛋白同源比对及进化树分析。结果表明，FtLAC-1基因序列开放阅读框为1695bp，编码564个氨基酸，FtLAC-2基因序列开放阅读框为1707bp，编码568个氨基酸。FtLAC-1和FtLAC-2蛋白预测分子量分别为61.41和62.47kDa，理论等电点分别为9.45和9.41，为亲水性蛋白，2个基因序列相似性较低，氨基酸序列同源性不高。qRT-PCR分析出其在苦荞不同组织器官存在差异性表达。结论为进一步探索FtLAC-1和FtLAC-2在苦荞薄果壳形成中的功能提供理论基础。

• 单位
  山西中医药大学; 云南省农业生物技术重点实验室; 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所