番茄黄化曲叶病毒北京分离物的全基因组序列测定及进化分析

作者：芦佳; 刘健; 王慧; 肖雅文; 李常保; 曹鸣庆; 徐杰; 姚磊

来源：内蒙古大学学报(自然科学版), 2014, 45(03): 273-280.

DOI：10.13484/j.nmgdxxbzk.20140308

• 番茄黄化曲叶病毒
• 分子检测
• 序列分析
• 进化

番茄黄化曲叶病(tomato yellow leaf curl disease,TYLCD)在我国危害日益严重.为了对该病进行深入有效的了解,根据已知的番茄黄化曲叶病毒(tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)基因组DNA-A序列的保守区段,设计两对背向引物;针对北京地区的3个TYLCV分离物进行分子鉴定.结果显示该分离物为单组分病毒,不含DNA-B和卫星DNA-β,是TYLCV的2个新分离物.TYLCV-BJ1与BJ2基因组全长分别为2781bp和2779bp,同源性为99.8%,都编码6个开放阅读框.对TYLCV的分子进化分析表明,国内现已发现的TYLCV株系亲缘关系都很接近,同源性在97.199.9%,属于以色列TYLCV-IL株系进化下的一个近代分支.从全基因组和各基因的逐个比对结果看,TYLCV的AV1和AV2保守性最高,其次是AC2和AC3.当TYLCV-Mld进化成TYLCV-IL时,AC1和AV4基因发生了较大的变化,IR区的同源性更是从小于70%上升到94.3%.国内的TYLCV株系分成2个亚群,但在地理分布上没有形成严格的区域限定,北京分离物属于CN I亚群.

• 单位
  内蒙古师范大学; 北京市农林科学院; 北京市农林科学院蔬菜研究中心