宏基因组二代测序在肺部感染病原诊断中的价值

作者：孟贝贝; 刘海潮; 胡振红; 屈磊; 方瑶

来源：中国热带医学, 2023, 23(11): 1173-1179.

DOI：10.13604/j.cnki.46-1064/r.2023.11.09

• 肺部感染
• 病原诊断
• 宏基因组二代测序
• 临床决策

目的 比较宏基因组二代测序（metagenomic next-generation sequencing, mNGS）与实验室传统培养在肺部感染病原中诊断的应用价值。方法 回顾性分析2021年2月—2022年9月中部战区总医院收治的310例疑诊肺部感染患者临床资料，分析mNGS与实验室传统培养检测结果，对比2种检测方法检测肺部感染病原的阳性率、灵敏性、特异性、准确性（accuracy, ACC）、阳性预计值（positive predictive value, PPV）、阴性预计值（negative predictive value, NPV）。结果 研究发现，mNGS能够同时检出多种病原，对细菌的检出效率最高，对真菌的检出阳性率最低，且mNGS检出的细菌、真菌与病毒的序列数之间有显著差异（H=70.361,P2=162.373,P2=148.120,P2=13.793,P<0.001）。结论 mNGS能够显著提高肺部感染病原的检出率，是传统实验室培养方法的必要补充，为指导临床抗感染治疗提供有力依据。同时，传统培养与mNGS病原检测方法都高度依赖于标本质量和检测质控，mNGS在提供无损的多种病原遗传信息的同时也需正确解读，才能正确甄别致病原。

• 单位
  武汉科技大学