GII.P7/GII.14型诺如病毒暴发的分子特征分析

作者：徐承; 付建光; 蒋翠莲; 艾静; 姚萍; 鲍昌俊; 朱叶飞

来源：国际病毒学杂志, 2017, 24(05): 300-304.

• 诺如病毒
• 暴发
• 基因型
• 重组

目的了解江苏地区3起诺如病毒(Norovirus,NoV)暴发疫情中病毒感染情况,并对其分子流行病学特征进行初步研究。方法收集暴发疫情中患者的肛拭子标本53份,采用实时荧光RT-PCR定性检测NoV,阳性标本利用普通RT-PCR对其聚合酶区(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)及衣壳蛋白区(VP1)片段进行扩增和测序分析。结果 3起NoV暴发疫情中,阳性检出率为56.6%(30/53)。对30株阳性标本序列进行分析,其RdRp区与GII.P7的同源性最高(93.86%),VP1区与GII.14的同源性较高(97.13%)。初步判断为GII.P7/GII.14重组毒株,SimPlot分析可能的重组位点在核苷酸5 009位。对其氨基酸序列进行分析发现在RdRp区和VP1区均出现部分氨基酸突变。结论 3起NoV暴发疫情均由同一重组毒株引起,提示GII.P7/GII.14重组株传染性较强,有可能再次引起暴发,应加强监测防控。

• 单位
  常州市疾病预防控制中心; 南京市妇幼保健院; 江苏省疾病预防控制中心; 南京医科大学第二附属医院