基于文本挖掘数据库干性年龄相关性黄斑变性免疫反应核心基因与关键通路的生物信息学分析

作者：魏航; 赵明威; 曲进锋

来源：中华眼科医学杂志(电子版), 2022, (5): 262-267.

DOI：10.3877/cma.j.issn.2095-2007.2022.05.002

• 干性年龄相关性黄斑变性
• 免疫反应
• 核心基因
• 信号通路
• 生物信息学

目的:利用生物信息学方法挖掘筛选干性年龄相关性黄斑变性(AMD)免疫反应过程中的核心基因与关键通路。方法:通过文本挖掘数据库pubmed2ensembl检索dry AMD和immune reaction的基因数据集。利用GeneCodis工具依次进行基因本体数据库(GO)功能富集及京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集。应用基于互联网的STRING数据库构建蛋白质相互作用(PPI)网络

• 单位
  第二临床医学院; 北京大学; 北京大学人民医院