日本血吸虫合抱相关未知功能基因SJCHGC00821的克隆及生物信息学分析

作者：戴橄; 汪世平; 余俊龙; 姜孝新; 曾少华; 徐绍锐; 李文凯

来源：中国现代医学杂志, 2006, 16(11): 1665-1668.

DOI：10.3969/j.issn.1005-8982.2006.11.019

• 日本血吸虫
• 合抱相关基因
• 基因克隆
• 生物信息学

目的克隆与日本血吸虫合抱相关但未知功能的新基因SJCHGC00821,构建其真核表达载体,并应用生物信息学初步探讨其功能.方法应用PCR技术从日本血吸虫成虫cDNA文库中扩增SJCHGC00821基因全长ORF,将其亚克隆到真核表达载体pcDNA3中,通过PCR、限制性酶切分析及测序进行鉴定.应用生物信息学初步分析其细胞定位、蛋白序列、结构域及功能.结果获得日本血吸虫合抱相关未知基因SJCHGC00821的克隆,序列分析结果提示该cDNA序列含有一个597 bp的完整阅读框序列,编码198个氨基酸,其编码蛋白的理论分子量为22.76 kDa,等电点为4.84.二级结构分析预测提示其具有一定抗原性.结论成功地克隆了日本血吸虫SJCHGC00821基因全长ORF,构建了其pcDNA3真核表达载体,为进一步研究其结构与功能创造了条件.

• 单位
  中南大学