甘蔗抗坏血酸过氧化物酶的电子克隆及生物信息学分析

作者：黄菲; 张云鹤; 李雪梅

来源：沈阳师范大学学报(自然科学版), 2013, (02): 295-300.

• 甘蔗
• APX
• 电子克隆
• 生物信息学 saccharum
• APX
• in silico cloning
• bioinformatics

电子克隆是随着EST计划和生物信息学发展起来的基因克隆策略。运用电子克隆的方法获得甘蔗S-APX2基因。以水稻中一个基因OsAPX2为种子序列,对甘蔗的EST数据库进行搜索,应用相关软件进行预测和分析。获得一个甘蔗APX基因S-APX2的cDNA序列全长,该序列长1110bp,包含一个完整的975bp的ORF,编码324个氨基酸;属于疏水性蛋白,编码蛋白含有Heme binding site,Substrate binding site,K+binding site,Ascorbate-peroxidase结合位点和保守域,属于Plant-peroxidase-like Superfamily...

• 单位
  沈阳师范大学