低深度全基因组拷贝数变异测序在复发性流产遗传学诊断中的应用

作者：张少芬; 王霄霜; 林桂丽; 徐晓园

来源：汕头大学医学院学报, 2023, 36(02): 100-105.

DOI：10.13401/j.cnki.jsumc.2023.02.008

• 高通量测序技术
• 低深度全基因组测序技术
• 复发性流产
• 拷贝数变异

目的：探讨基于高通量测序技术的低深度全基因组测序技术在复发性流产胚胎或绒毛组织染色体异常的应用价值。方法：选择2019年3月—2021年8月就诊于汕头大学医学院第一附属医院妇产科门诊并确诊为自然流产的患者，孕周为5～16周，留取流产组织，提取DNA，制备文库，进行流产物染色体低深度全基因组拷贝数变异测序，分析胚胎染色体数目和结构变异结果。结果：197例样本检测全部成功，检出染色体异常样本135例，染色体异常检出率为68.5%，其中检出染色体数目异常104例（77.0%），染色体部分重复/缺失26例（19.3%），染色体数目异常合并部分重复/缺失5例（3.7%），嵌合体10例（7.4%）；染色体数目异常以16 (11.85%)、X (9.63%)、22 (96.67%)、21 (5.93%)染色体高发。≥35岁患者的染色体数目异常率比<35岁患者的高（分别为70.0%和51.6%,P<0.05）。共检出26例染色体部分重复/缺失，最短序列长度为0.12 Mb，最大片段94.54 Mb。在26例CNVs中，9例CNVs有明确致病性，2例CNVs提示可能致病。其中4个包含微缺失/微重复综合征。结论：低深度全基因组拷贝数变异测序技术能有效检测出流产胚胎绒毛组织染色体的非整倍体和部分重复/缺失情况，有助于明确复发性流产的病因，指导患者优生优育。

• 单位
  汕头大学医学院第一附属医院