SARS冠状病毒S2基因变异性分析

作者：周浩; 龙北国; 张文炳; 江丽芳; 陈丽丹; 贡树基; 赵卫

来源：南方医科大学学报, 2006, 26(04): 463-465+471.

DOI：10.3321/j.issn:1673-4254.2006.04.021

• SARS-CoV
• S2基因
• 序列分析

目的测定SARS冠状病毒GD322株S2基因序列并对SARS-CoV S2基因进行系统进化树分析。方法用RT-PCR 法从SARS-CoV GD322株基因组中扩增S2基因片段并克隆至pGEM-T载体,转化大肠杆菌DH5α株后测序。利用 Lasergene、ClustalX、DNAman和Treeview等软件,将基因序列翻译成氨基酸序列后,与早、中、晚期各地暴发的SARS-CoV S2蛋白序列进行比对,构建系统进化树,并在Internet网数据库中对S2蛋白氨基酸序列进行T细胞抗原表位预测。结果随着SARS-CoV的传播流行,S2基因趋于稳定,晚期的SARS-CoV S2基因的同源性达到99．9％。T细胞抗原表位预测发现,SARS-CoV S2蛋白第57位氨基酸突变对T细胞抗原表位有影响。结论 SARS流行过程中SARS-CoV S2 基因较为稳定,S2蛋白57位氨基酸的突变可影响病毒T细胞抗原表位。

• 单位
  中山大学中山医学院; 南方医科大学