本公开揭示了一种深空通信系统的信道编译码系统以及译码方法,涉及通信技术领域。本公开选用极化码作为深空通信信道编译码方案,提出深空通信的信道模型并采用Tal-Vardy方法对所述信道模型构造极化码。经过仿真得出如下结论:在低信噪比时,将极化码作为深空通信系统的信道编译码能够有效的提高通信质量,并且使用本公开所述的改进E-SCL译码算法,误帧率要低于SC译码算法,且其误帧率同SCL译码算法的误帧率相当。