肾母细胞瘤肿瘤微环境相关预后基因鉴定及免疫浸润模式识别

作者：谭小军; 周玉; 伍季; 韦堂墙^*

来源：重庆医学, 2022, 51(12): 2090-2103.

• 肾母细胞瘤
• 肿瘤微环境
• 免疫浸润
• 生物信息学
• TCGA

目的 探索肾母细胞瘤(WT)中肿瘤微环境(TME)相关基因、免疫细胞浸润模式及其对预后判断的价值。方法 从肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库下载WT基因表达及临床数据，通过ESTIMATE算法估计基质评分、免疫评分及总评分，并根据评分中位数分为高、低评分两组，寻找差异表达基因(DEGs)并进行基因本体论(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。单因素及多因素COX回归分析判定DEGs与预后的相关性，构建预后模型。通过MCPcounter算法评估标本免疫浸润模式的特点。结果 对124份WT肿瘤组织进行ESTIMATE评分，显示基质评分和总评分与预后相关，评分高的患者生存时间较评分低的患者长(P=1.973×10-3、1.718×10-3)。KEGG富集分析显示，DEGs主要集中在磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路、肾素分泌等通路。构建包含REN/ST6GALNAC1/GABRA5/C10orf71/FMOD共5个基因的预后模型，受试者工作特征(ROC)曲线、校正曲线、决策曲线均显示模型预测能力良好。采用MCPcounter评估肿瘤组织和癌旁正常组织中免疫细胞的浸润数量，发现癌旁正常组织T淋巴细胞、髓样树突状细胞、中性粒细胞、内皮细胞数量高于肿瘤组织，并且Kaplan-Meier(KM)生存曲线显示较高T淋巴细胞浸润预示着更好的预后。不同性别的患者免疫细胞浸润模式无明显差异，低年龄患儿(<3岁)中性粒细胞、单核细胞、内皮细胞数量更多。结论 WT中TME相关基因ST6GALNAC1、REN对患儿预后判断有潜在的临床价值，WT组织的免疫细胞浸润模式存在差异，与患者的临床特征和预后相关。这些基因、免疫细胞可能作为预后指标及治疗靶点。

• 单位
  第二临床学院; 川北医学院; 南充市中心医院