引物3'端第二个碱基SNP变异的长度多态性遗传标记检测

作者：黄健; 汤美云; 蔡金洪

来源：中国法医学杂志, 2017, 32(02): 171-174.

DOI：10.13618/j.issn.1001-5728.2017.02.014

• 法医物证学
• 三条引物
• 等位基因特异性PCR
• 3’末端
• 点突变

目的为了获得引物3’端存在SNP点突变的插入缺失遗传标记rs10644346所有等位基因片段。方法基于等位基因特异性PCR原理,设计一条共用上游引物,二条3’端倒数第二个位置特异性碱基的下游引物。运用该三条引物检测150个无关个体及10例亲子关系已确定的三联体,同时运用其中二条引物(共同上游引物和其中一条下游引物)扩增9例样本。结果三条引物扩增150个无关个体均有清晰扩增片段;10例三联体案例亲代与子代扩增片段均符合孟德尔遗传定律;二条引物扩增9例样本后发现特定片段丢失。结论本次研究设计的三条引物PCR,证明特异性碱基位置除了通常的3’末端,理想条件下3’端的其他位置(如倒数第二个位置)也可以成为有效选择,该三条引物设计方法为检测引物侧翼存在点突变的遗传标记提供了一种新的参考。

• 单位
  湖南省脑科医院; 湖南中医药大学