基于RNA-seq技术对静原鸡不同部位肉质相关差异基因的筛选

作者：虎红红; 母童; 马正旭; 冯小芳; 蔡正云; 黄增文; 顾亚玲; 辛国省; 张娟^*

来源：基因组学与应用生物学, 2021, Z1: 2038-2046.

DOI：10.13417/j.gab.040.002038

• RNA-seq
• 肉品风味
• 静原鸡
• 基因注释

利用转录组筛选宁夏地方品种静原鸡肉品风味的相关差异基因,了解差异基因对肉品风味转录调控的影响。采集15只静原鸡胸肌和腿肌,利用RNA-seq技术,通过GO、KEGG富集和蛋白网络互作等生物信息学分析筛选调控肉品风味相关的差异表达基因。结果表明:静原鸡胸肌、腿肌中显著差异表达基因总数为2 098个,其中,与腿肌相比,胸肌有1 146个基因显著上调(P<0.05),952个基因显著下调(P<0.05)。GO功能注释中磷代谢占生物学过程最多,肌动蛋白细胞骨架和肌动蛋白肌球蛋白复合体极显著富集在细胞组分中(P<0.01),激酶活性占分子功能最多。KEGG功能注释发现差异基因显著富集到糖酵解和糖异生途径、心肌收缩、紧密接头、甘油磷脂代谢途径等通路中,最终筛选出PGM1、PFKM、PFKL、GPI和ETNPPL等5个可能与静原鸡肉品风味相关的显著上调基因。以上研究结果为阐明其与肉品风味的关系及进一步研究静原鸡肉品风味相关调控基因提供理论依据。

• 单位
  宁夏大学