生物信息学分析CA3在乳腺癌组织中的表达和对预后的影响

作者：张江涛; 阮晖朝; 吴向华^*

来源：中国普外基础与临床杂志, 2022, 29(01): 51-58.

• 乳腺癌
• 碳酸酐酶3
• 预后
• 免疫浸润
• 生物信息学

目的通过多种在线数据库分析碳酸酐酶3(carbonic anhydrase 3,CA3)在乳腺癌中的表达差异、预后潜力以及相关机制。方法使用GEPIA2.0和TIMER数据库资料分析CA3 m RNA在乳腺癌组织中的表达差异;使用Bc-Gen Ex Minerv4.7数据库资料分析乳腺癌亚分类的CA3 m RNA的表达差异;使用Kaplan-Meier绘图仪、Bc-Gen Ex Minerv4.7和Progno Scan数据库资料分析CA3 m RNA表达水平与乳腺癌患者预后的关系;使用Linked Omics数据库资料分析CA3共表达基因及其生物学行为;使用TIMER数据库资料分析乳腺癌组织中CA3m RNA的表达与免疫细胞浸润的关系。结果乳腺癌组织中CA3 m RNA表达水平低于正常乳腺组织(P<0.05),在ER阴性(P<0.05)、PR阴性(P<0.05)、HER2阴性(P<0.05)以及无淋巴转移者(P<0.05)其表达水平较高,且在高表达Ki67乳腺癌患者中CA3表达水平较低(P<0.05),与SBR和NPI分级也具有相关性(P<0.05);CA3 m RNA表达水平低的乳腺癌患者其总体生存率、无复发生存率和无病生存率均较低(P<0.05);筛选出的正相关前50个共表达基因有10个基因具有低风险比(P<0.05),筛选出的负相关前50个共表达基因中有11个基因具有高风险比(P<0.05);在乳腺癌组织中CA3 m RNA表达与CD4+T细胞和CD8+T细胞具有正相关关系(rs=0.175,P<0.001;rs=0.137,P<0.001),与T细胞衰竭标志物LAG3、TIM-3和PVRL2呈负相关关系(rs=–0.100,P<0.01;rs=–0.143,P<0.001;rs=–0.082,P<0.05)。结论 CA3 m RNA在乳腺癌组织中的低表达与乳腺癌的发生发展及预后存在一定的相关性,有望作为乳腺癌预后潜在标志物,可能与免疫浸润有关。

• 单位
  广西医科大学第一附属医院