基于BSA的玉米花期相关性状基因定位

作者：孙家臣; 蒋辅燕; 尹兴福; 毕亚琪; 郭瑞佳; 胡灿; 王宇玲; 番兴明^*

来源：玉米科学, 2023, 31(03): 48-57.

DOI：10.13597/j.cnki.maize.science.20230307

• 玉米
• 花期
• 集群分离分析
• 基因定位
• 欧氏距离

通过自交系R146与其早花期自然突变体ER146构建901个单株的F2群体，利用集群分离分析(BSA)中的欧氏距离(ED)算法与ΔSNP-index/ΔInDel-index算法，获得控制吐丝期性状基因的候选区间和位点，对候选基因进行功能注释。结果表明，通过ED值算法获得全基因组内最大的3号染色体上的ED关联区间，基于上述ED关联区间进一步通过ΔSNP-index/ΔInDel-index算法在此区间内检测出1个0.268 Mb的主效区间和19个微效位点。基因功能注释结果发现，主效区间内的1个基因和微效位点中的5个基因与玉米花期相关，此外还在主效区间发现了2个潜在的新基因。

• 单位
  云南农业大学; 云南大学; 云南省农业科学院粮食作物研究所