ABA和干旱胁迫下菊花脑ZF-HD基因家族的表达分析

作者:陈楚怡; 杨小梅; 陈胜艳; 陈斌; 岳莉然*
来源:生物技术通报, 2023, 39(11): 270-282.
DOI:10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2023-0530

摘要

干旱是影响菊花生长发育和产量的重要非生物因子,在应对干旱胁迫时ZF-HD转录因子家族起着重要的作用。菊花脑是研究菊花遗传育种机制的模式植物,筛选其抗旱相关基因可为菊花相关研究奠定基础。本研究在菊花脑基因组基础上,建立了本地数据库以实现本地BLAST,并利用Pfam数据库、HMMER、DNAMAN、MEGA、Tbtools、ExPASy、WOLF PSORT在线网站及实时荧光定量技术,对ZF-HD基因家族进行筛选以及生物信息学和表达分析。最终在菊花脑基因组中共鉴定出19个CnZFHD基因,分为ZHD、MIF两个亚家族,其中ZHD亚族包括I-VI亚群。家族成员的组织特异性表达具有时间和空间差异性,且启动子区富含与生长发育、胁迫和激素相关的响应元件。RT-qPCR结果显示,19个CnZF-HD基因均响应干旱胁迫和ABA处理,且在干旱条件下均被诱导表达。CnZF-HD4、CnZF-HD5、CnZF-HD9、CnZF-HD10、CnZF-HD14、CnZF-HD15、CnZF-HD19这7个基因在ABA处理中被诱导表达,亚群VI在调控菊花脑抗旱性方面起着重要作用。另外,CnZF-HD1基因的表达在干旱条件下持续上调,可作为抗旱相关的候选基因,但其对ABA的敏感性需要进一步研究。

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