《政府会计制度》执行过程中存在的问题屡见不鲜,新旧制度衔接亟待加强、内部财务管理制度和体系有待更新和完善、财务人员业务能力参差不齐、旧制度账务追溯调整难度大、财务信息系统跟不上等是执行过程中的较为突出的五个困境,基于此,结合高校的实际情况,提出了相应的对策建议,为各高校财务管理工作提供相应的借鉴。