基于SINE-RIPs标记的苏姜猪群体结构和遗传多样性分析

作者：迟诚林; 倪黎纲; 陶勇; 陈才; 周春宝; 宋成义; 王宵燕^*

来源：中国畜牧杂志, 2023, 59(02): 147-154.

DOI：10.19556/j.0258-7033.20211213-09

• 反转录转座子插入多态
• 苏姜猪
• SINE
• 群体结构

为了探究苏姜猪群体遗传结构与遗传多样性，本研究采用36个SINE-RIPs(SINE Retrotransposon Insertion Polymorphisms)标记检测苏姜猪育种核心群体的基因多态性，并分析群体的遗传参数，构建UPGMA(Unweightedpair Group Method Arithmeticmean)系统发育树。结果发现，苏姜猪群体中存在29个SINE-RIPs多态性，UPGMA系统发育树将苏姜猪群体分为10个家系，家系的PIC范围为0.1883～0.2371,Fst的范围为0.011 7～0.299 1,Fis的范围为-0.902 0～-0.049 3，说明苏姜猪群体存在丰富的遗传多样性，群体近交程度较低。该研究结果为苏姜猪的持续选育和开发利用提供参考依据。

• 单位
  扬州大学; 江苏农牧科技职业学院