宏基因组高通量测序在免疫缺陷患者肺部感染诊断与治疗中的应用价值

作者：段智梅; 沈志勇; 胡晔; 王凯飞; 付晗; 王晨雷; 解立新; 谢菲^*

来源：中华医学杂志, 2023, 103(25).

• 支气管肺泡灌洗液
• 宏基因组高通量测序
• 免疫缺陷
• 肺部感染

目的评价宏基因组高通量测序(mNGS)在免疫缺陷患者肺部感染诊断与治疗中的应用价值。方法回顾性选取2018年11月至2022年5月在解放军总医院呼吸与危重症医学部第一医学中心重症监护室的78例免疫缺陷肺部感染患者[男55例, 女23例, 年龄(50.3±16.9)岁]和61例非免疫缺陷肺部感染患者[男42例, 女19例, 年龄(63.6±15.9)岁]。两组患者在临床诊断为肺部感染的同时, 均行支气管肺泡灌洗液(BALF)的mNGS及常规微生物学检测(CMTs)。比较两种检测方法的诊断阳性率、病原体检出率以及与临床符合率的差异。同时比较两组患者根据mNGS检测结果抗感染治疗策略调整率的差异。结果免疫缺陷组与非免疫缺陷组肺部感染患者mNGS诊断阳性率分别为94.9%(74/78)和82.0%(50/61), CMTs诊断阳性率分别为64.1%(50/78)和75.4%(46/61), 免疫缺陷组mNGS与CMTs诊断阳性率差异有统计学意义(P<0.001)。mNGS在免疫缺陷组中耶氏肺孢子菌、巨细胞病毒的检出率分别为41.0%(32/78)、37.2%(29/78), 在非免疫缺陷组中肺炎克雷伯菌、鹦鹉热衣原体、嗜肺军团菌的检出率分别为16.4%(10/61)、9.8%(6/61)、8.2%(5/61), 均高于CMTs的1.3%(1/78)、7.7%(6/78)、4.9%(3/61)、0、0(均P<0.05)。免疫缺陷组mNGS、CMTs与临床符合率分别为89.7%(70/78)、43.6%(34/78), 差异有统计学意义(P<0.001)。非免疫缺陷组mNGS、CMTs与临床符合率分别为83.6%(51/61)、62.3%(38/61), 差异有统计学意义(P=0.008)。免疫缺陷组根据mNGS病原学结果, 抗感染治疗策略调整率为87.2%(68/78), 非免疫缺陷组抗感染治疗策略调整率为60.7%(37/61), 差异有统计学意义(P<0.001)。结论在免疫缺陷肺部感染患者中, 与CMTs相比, mNGS在诊断阳性率、混合型感染诊断率、病原体检出率及指导抗感染治疗策略的调整方面更具优势, 值得临床推广应用。

• 单位
  解放军总医院; 沧州市中心医院; 福建省晋江市医院