龙眼Dlc4h基因组织特异性表达及其生物信息学分析

作者：张秋颖; 郑威^*; 董学明; 于雪飞; 陈宁^*; 任禾群

来源：分子植物育种, 2019, 17(24): 8039-8049.

DOI：10.13271/j.mpb.017.008039

• 龙眼(Dimocarpus longan Lour.)
• 肉桂酸4-羟化酶
• 生物信息学分析

肉桂酸4-羟化酶(cinnamate-4-hydroxylase, c4h)是合成黄酮类化合物的关键酶之一。为了研究Dlc4h基因的结构及其在龙眼次级代谢产物合成中的功能,本研究采用实时荧光定量PCR (qRT-PCR)技术分析Dlc4h基因在龙眼根、茎、叶组织中的特异性表达,并对该基因进行了生物信息学分析。定量分析结果表明:Dlc4h基因在各组织中均有表达,表达量由高到低依次为根、茎、叶。生物信息学分析结果表明:该基因全长1 611 bp,编码536个氨基酸;蛋白质相对分子质量为61 389.45 Da,等电点(pI)为8.82;它是一种不含信号肽、有跨膜结构、定位于质膜的可溶性亲水蛋白;二级结构主要包括α-螺旋和无规则卷曲,并具有卷曲螺旋结构;采用SWISS-MODEL构建Dlc4h三级结构模型,运用Ramachandran评估表明该模型准确可靠;Dlc4h预测得到的配体结合位点分别为128Arg、145Val、146Phe、153Trp、157Arg、213Met、329Ile、332Ala、333Ala、336Thr、337Thr、340Ser、402His、467Pro、468Phe、473Arg、475Cys和476Pro。本研究的结果为进一步研究Dlc4h基因在龙眼黄酮类化合物生物合成途径中行使的功能提供依据。

• 单位
  哈尔滨商业大学