宫颈癌组织和Siha细胞株HPV16病毒整合位点的检测与分析

作者：陈琳; 郑莹

来源：四川大学学报（医学版）, 2016, 47(04): 495-500.

DOI：10.13464/j.scuxbyxb.2016.04.009

• 宫颈癌
• 高危型人乳头瘤病毒
• DIPS-PCR
• 整合
• 脆性位点
• 启动子

目的利用DIPS-PCR方法建立宫颈癌组织HPV16病毒整合位点图谱,并利用软件分析存在的优势整合位点及整合位点处启动子序列。方法细胞培养Siha细胞株,PCR扩增并筛选出单一HPV16感染的临床标本,利用DIPS-PCR方法检测Siha细胞株和单一HPV16感染的临床宫颈癌标本中病毒整合位点。结果发现Siha细胞株HPV16整合位点13q22;宫颈癌组织整合位点在1、3、5、6、8、10、11、13、14、15、17、19及X染色体上,整合位点在染色体的分布是随机的,但其多集中于染色体脆性部位及其附近区域。整合位点多见于1p35.1、5p15.3、10q24、13q21q22、Xp11.4。利用CBS prediction servers和BDGP Neural Network Promoter prediction软件分析发现整合位点存在高度疑似启动子序列。结论 DIPS-PCR在DNA水平可有效检测宫颈癌组织和Siha细胞株HPV16整合位点,整合位点多出现在染色体的脆性位点处,且该脆性部位可能存在某些使病毒癌基因过度表达的启动子序列。

• 单位
  四川大学华西第二医院