miR-22-3p在鼻咽癌中的表达及靶基因功能分析

作者：尹梦婕; 吕艳茹; 蒿艳蓉^*; 曹宇华; 袁贤彬; 谢嫣嫣; 徐志勇; 高珊; 莫华清; 沈婧怡

来源：医学研究生学报, 2020, 33(11): 1127-1133.

DOI：10.16571/j.cnki.1008-8199.2020.11.002

• 鼻咽癌
• miR-22-3p
• 生物信息学

目的目前关于鼻咽癌中miR-22-3p的表达情况和作用机制尚不明确。文中旨在研究miR-22-3p在鼻咽癌中的表达情况,分析其表达对鼻咽癌发生发展的影响。方法从GEO数据库中下载鼻咽癌组织miRNA表达数据GSE36682,分析miR-22-3p在鼻咽癌组织中的表达变化,应用qRT-PCR在鼻咽癌细胞中进一步验证。根据慢病毒转染分为:过表达组(转染miR-22-3p过表达慢病毒)、阴性对照组(空载病毒)、空白组(不转染)。应用生物信息学软件及数据集GSE53819中预测并筛选表达有差异的靶基因,并进行GO功能及KEGG通路富集分析,同时构建靶基因的蛋白互作网络并找出其关键基因,探究miR-22-3p表达失调在鼻咽癌中发生发展过程中的作用。结果鼻咽癌中miR-22-3p呈明显低表达(P<0.01)。ROC曲线表明在鼻咽癌中miR-22-3p的表达具有一定诊断效能(AUC:0.984,95%CI:0.970～0.998)。过表达组WNT5A相对表达量(0.423±0.079)明显低于空白组(1.000±0.000)、阴性对照组(0.915±0.237),差异有统计学意义(P<0.05);CXCL5亦明显降低(P<0.05)。在生物信息学软件及数据集中预测并筛选后得到201个差异表达的miR-22-3p的靶基因,GO功能分析表明miR-22-3p靶基因产物主要涉及对无机及有机物质的反应、Wnt受体信号通路等生物学过程,还包括跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活性、蛋白域特异性结合等分子功能,KEGG通路富集分析表明这些靶基因主要参与趋化因子信号通路、癌症通路。此外, WNT5A、GNG7、CXCR5、CCR7、CXCL5、TFRC、STAT1、CX3CR1、KIAA0319为筛选出的miR-22-3p的关键靶基因,其中WNT5A、CXCL5、TFRC、STAT1呈现表达上调,CXCR5、GNG7、CCR7、CX3CR1、KIAA0319呈现表达下降(P<0.01)。预后分析发现GNG7、CXCR5、CCR7、CX3CR1低表达及TFRC的高表达与头颈部鳞癌的不良预后具有明显的相关性(P<0.01)。结论 miR-22-3p在鼻咽癌中表达下调,可能通过调控其靶基因WNT5A、CXCL5等在鼻咽癌中发挥重要作用。

• 单位
  广西壮族自治区人民医院