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摘要
油桐尺蛾核型多角体病毒广西株基因组序列由Sanger测序的方法得到.拼接后获得了121 268 bp序列,GC含量为36.76％.以长度不小于50 aa的序列认定为功能基因,共预测到131个开放阅读框,通过Blast比对,其中87个能注释到功能基因.对基因组序列进重复序列分析,共发现SSR位点174个,同源重复序列1个.在SSR位点中,包含6种长度的重复基序,且以富含AT的重复基序为主.同源重复序列两端为-59 bp片段或其一部分组成的重复序列,两端分别重复12次和7次,中间则为一段与重复片段无关的236 bp片段.与武汉株相比,广西株病毒在37个核心基因中有4个存在蛋白序列长度上的差异,而在其他非核心基因中有6个基因仅存在于一个病毒株中,另有13个基因存在蛋白序列长度上的差异.
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