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摘要
为确定桃叶珊瑚属(Aucuba)植物叶绿体基因组的结构及其序列变异，揭示其属下种间亲缘关系，该研究对桃叶珊瑚(A.chinensis)、花叶青木(A.japonica var.variegata)等6种桃叶珊瑚属植物和丝缨花属植物黄杨叶丝缨花(Garrya buxifolia)进行二代测序，利用生物信息学软件对其叶绿体基因组序列进行组装和注释，并进行基本特征分析、序列比较以及系统发育分析。结果表明：(1)桃叶珊瑚属植物叶绿体基因组具典型的环状四分体结构，6条序列全长157 891～158 325 bp,均编码114个基因，包括80个蛋白质编码基因、30个tRNA基因和4个rRNA基因。(2)6种植物叶绿体基因组高频密码子数均为29个，偏好以A/U结尾，确定了这6条序列的最优密码子共100个，包含12个共有的最优密码子。(3)6条叶绿体基因组序列共检测到270条散在重复序列，133条串联重复序列以及412个SSR位点。(4)比较基因组学分析结果表明，该属植物叶绿体基因组序列高度保守。(5)从叶绿体基因组中筛选出10个高变片段。(6)系统发育分析结果显示支持桃叶珊瑚属为一个支持率较高的单系，与丝缨花属关系较近。该研究中的5种桃叶珊瑚属植物以及1种丝缨花属植物的叶绿体基因组均为首次测序组装，揭示了桃叶珊瑚属及其属下种间的系统发育关系，为桃叶珊瑚属植物的分类鉴定和系统发育提供了参考资料。
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