苦荞糖转运载体FtSWEETs的鉴定与生物信息学分析

作者：梁成刚; 关志秀; 章洁琼; 韦春玉; 石桃雄; 黄娟; 邓娇; 孟子烨; 汪燕^*

来源：分子植物育种, 2023, 21(09): 2872-2880.

DOI：10.13271/j.mpb.021.002872

• 苦荞
• 糖转运体
• 生物信息学
• 基因表达

植物SWEET转运蛋白是介导糖类进行跨膜运输的重要载体。本研究基于苦荞转录组测序数据库，筛选到34个FtSWEETs基因。基因序列分析发现，苦荞FtSWEETs基因序列长度为533～2 890 bp，编码氨基酸残基为51～327个。聚类分析发现，苦荞FtSWEETs被归为4类，4个属于类型I,9个属于类型Ⅱ，6个属于类型Ⅲ，11个属于类型Ⅳ。蛋白序列分析发现，29个FtSWEETs的最长开放阅读框(MaxORF)编码蛋白具有跨膜结构域。基于苦荞茎的转录组测序分析，共检测到15个FtSWEETs基因在苦荞幼苗茎中表达，包含11个差异表达基因(DEGs)。其中，4个DEGs在出苗后5 d的茎中高表达，随后急剧下降；4个DEGs在出苗后5～15 d的茎中表达量逐渐下降；1个DEG在出苗后10和15 d的茎中高表达，2个DEGs在出苗后15 d的茎中高表达，推测这可能与它们在不同发育阶段发挥特定功能有关。相关性分析发现苦荞FtSWEETs基因间存在多个显著正相关或负相关关系，说明其可能存在协同或功能互补效应。本研究为进一步探索苦荞糖转运的分子调控机制提供了依据。

• 单位
  生命科学学院; 贵州师范大学