本发明公开了一种酶催化合成苯丙氨酸寡肽-赖氨酸寡肽共聚物的方法,属于材料科学领域。本发明使用蛋白酶为催化剂催化合成酪氨酸寡肽和苯丙氨酸寡肽,然后在固定化蛋白酶的催化下在壬烷/二甲亚砜混合溶剂中将赖氨酸寡肽、苯丙氨酸寡肽进行聚合,制备得到苯丙氨酸寡肽-赖氨酸寡肽共聚物。本发明的苯丙氨酸寡肽-赖氨酸寡肽共聚物的产率达到45~75%。该方法涉及的苯丙氨酸寡肽-赖氨酸寡肽共聚物的合成催化剂为固定化酶,具有反应条件温和、环境更友好、副反应少等优点,而且避免了繁琐的保护和去保护步骤。