小粒黑豆GmRHF1基因生物信息学及线虫诱导表达分析

作者：王芳; 吴鹏; 张珍珠; 刘林馨; 段玉玺^*

来源：河南农业科学, 2019, 48(07): 74-80.

DOI：10.15933/j.cnki.1004-3268.2019.07.011

• 大豆
• RING-H2 zinc finger蛋白
• 生物信息学
• 表达模式
• 大豆胞囊线虫

为研究E3泛素连接酶基因在大豆抗线虫病害中的功能,利用RT-PCR方法从大豆胞囊线虫(Heterodera glycines)侵染的小粒黑豆(Glycine max)根部组织中克隆到1个E3泛素连接酶RING家族基因GmRHF1。序列分析结果显示,该基因位于大豆基因组3号染色体上,具有一个完整的外显子,编码区长度783 bp,编码260个氨基酸,含有1个RING-H2模体和1个跨膜结构域。蛋白质分子质量为27 880.43 u,理论等电点为5.59。同源性比对及系统进化分析表明,该蛋白质与ATL3蛋白亲缘关系最近,属于RING-H2 zinc finger ATL3类。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析GmRHF1受大豆胞囊线虫侵染的诱导表达情况,结果表明,接种后48 h内该基因的表达量较未接种的样品显著增加,推测该基因介导小粒黑豆抗大豆胞囊线虫的防御反应。

• 单位
  齐齐哈尔大学; 沈阳农业大学